L’organo superiore di Braunvieh Schweiz è l’assemblea generale che si tiene una volta l’anno. Il comitato della federazione, sotto la direzione del presidente, dirige Braunvieh Schweiz a livello strategico. A livello operativo, la federazione è diretta dal direttore, sostenuto da un vicedirettore e differenti responsabili dei dipartimenti. Alla sede della federazione a Zugo sono impiegati circa 40 collaboratori, servizio esterno compreso (dei quali molti con un impiego a tempo parziale).