Génomique – expliqué de manière claire et concise
Grâce à sélection génomique ne peut plus être estimé uniquement sur la base des données de performance et de généalogie, mais aussi sur la base de son patrimoine génétique. La base pour cela est constituée par les soi-disant SNP (Polymorphismes nucléotidiques simples), c'est-à-dire des paires de bases individuelles dans le brin d'ADN, qui sont réparties uniformément dans l'ensemble du génome et peuvent être déterminées en laboratoire. Au total, plusieurs dizaines de milliers à cent mille de ces Marqueur pris en compte. Des marqueurs individuels peuvent présenter des effets spécifiques, négatifs – ceux-ci sont alors signalés comme des tares génétiques –, mais aussi positifs, tels que l' polled génétique (sans cornes).
Das procédure en une seule étape poursuit une approche intégrée. Ici, toutes les informations disponibles – données de performance, ascendance et génotypes – convergent simultanément en un seul modèle d'estimation. Au lieu d'une procédure en deux étapes, on utilise une matrice de parenté combinée qui représente à la fois l'information de pedigree conventionnelle et la similarité génomique entre les animaux. Basé sur le Effets des SNP Pour la population de référence des évaluations de la valeur d'élevage menées trois fois par an, des effets SNP sont estimés pour les jeunes animaux toutes les deux semaines. La population de référence dans la méthode en une seule étape (single-step) est constituée d'animaux possédant un génotype et un phénotype, c'est-à-dire principalement des vaches. Grâce au génotypage, les valeurs d'élevage d'un animal deviennent nettement plus fiables.
La déclaration des animaux avec des informations génomiques varie selon les autres sources d'information combinées avec le génotypage :
| animal au génotype | Bonjour |
| Animal avec génotype + valeur d'élevage Interbull | GI |
| animal avec génotype + valeur d'élevage CH + éventuellement Interbull | G |
| Bonjour | valeur d'élevage issue d'informations généalogiques et d'informations génomiques |
| GI | Valeur d'élevage basée sur les informations de généalogie, les informations génomiques et les informations phénotypiques issues de l'évaluation internationale de la valeur d'élevage (Interbull), sans information phénotypique nationale (CH) |
| GI | Valeur d'élevage issue d'informations sur la généalogie, d'informations génomiques et d'informations phénotypiques nationales (CH) + éventuellement d'informations issues de l'estimation internationale de la valeur d'élevage (Interbull) |
La puce SWISScow développée par Qualitas
Le génotypage par SNP a lieu aujourd'hui au laboratoire IFN à Berlin avec un test nouvellement développé par Qualitas et ses partenaires et optimisé pour les races suisses Puce à ADN. Il s'agit du Puce personnalisée SWISScow 300k. Un grand avantage de la nouvelle puce est que tous les tests génétiques individuels pertinents pour le BS et l'OB sont fournis sans frais supplémentaires (Sans cornes, kappa-caséine, bêta-caséine A2, tous les défauts héréditaires, y compris le nouveau haplotype d'origine 1).
Avantages
- Vous bénéficiez d'un plus grand progrès d'élevage par une sélection plus stricte d'animaux.
- Grâce à un raccourci intervalle de générations le progrès génétique chez les taureaux est accru.
- Les jeunes taureaux présentent avec une bonne certitude déjà des valeurs d'élevage pour presque tous les caractères.
- Les valeurs d'élevage génomiques sont utilisées par les organisations d'IA lors de la sélection des Mères de taureaux pris en compte.
- Le typage génomique permet de déterminer toutes les tares héréditaires connues ainsi que les marqueurs génétiques tels que la kappa-caséine, la bêta-caséine A2 ou l'absence de cornes.
Prélèvement
L'échantillon pour l'examen peut être prélevé au moyen de Carte de fidélité coiffure ou Boucle d'oreille en tissu avoir lieu.
Pour l'analyse capillaire, il faut arracher 50 à 100 poils avec leurs racines à la base de la queue. Afin de garantir un traitement rationnel, les échantillons doivent être étiquetés avec l'adhésif TVD. Le formulaire de commande est transmis via BrunaNet imprimé et joint à l'échantillon de poils. Des instructions détaillées pour le prélèvement des échantillons et l'établissement du bon de commande sont disponibles dans la rubrique Téléchargements. Les cartes à poils peuvent être commandées auprès de Braunvieh Suisse par téléphone, par e-mail ou via WhatsApp.
La marque auriculaire pour le prélèvement de tissus permet le marquage de l'animal et le prélèvement du tissu en une seule étape. Sur la base du tissu, le laboratoire peut analyser les SNP et calculer les valeurs d’élevage génomiques. L'un des avantages de la marque auriculaire en tissu est que le génotypage classique ne nécessite plus l'entrée de la commande via BrunaNet. Le matériel d'échantillonnage peut être envoyé à Qualitas SA avec les enveloppes à bulles qui sont jointes aux marques auriculaires. Les marques auriculaires pour le prélèvement de tissu peuvent être commandée via Identitas SA de la même manière que pour les marques auriculaires classiques.
| Mode de prélèvement | Kléber | Commande |
|---|---|---|
Carte de fidélité coiffure | Avec de la colle TVD | Créer une commande |
| Sans colle TVD | Créer et imprimer la commande | |
cornet de glace | Avec de la colle TVD | Non |
| Sans colle TVD | Créer et imprimer la commande | |
Boucle d'oreille en tissu | Non |
Utilisez la sélection génomique pour faire progresser votre élevage !
Dates de publication
| 09.12.2025 | 23.12.2025 |
| 13.01.2026 | 27.01.2026 |
| 10.02.2026 | 24.02.2026 |
| 10.03.2026 | 24.03.2026 |
| 14.04.2026 | 28.04.2026 |
| 12.05.2026 | 02.06.2026 |
| 16.06.2026 | 23.06.2026 |
| 14.07.2026 | 28.07.2026 |
| 25.08.2026 | 08.09.2026 |
| 22.09.2026 | 06.10.2026 |
| 20.10.2026 | 03.11.2026 |
| 17.11.2026 | 08.12.2026 |
| 22.12.2026 |
Marqueurs génétiques
Braunvieh Schweiz réfute les informations concernant statut d'erreur héréditaire des animaux sur le certificat d'origine, la fiche de production ou dans d'autres documents du livre généalogique. La déclaration des tares génétiques se fonde sur les décisions de l'Union européenne des éleveurs de bétail brun. Elle est concertée au niveau international et s'effectue de la même manière dans les autres pays élevant du Betail brun. Les taureaux prévus pour l'insémination artificielle doivent être testés pour toutes les tares génétiques connues. Les taureaux identifiés comme porteurs d'arachnomélie (syndrome de l'araignée) ne doivent pas être utilisés.
Déclaration des vices héréditaires
Les lettres suivantes sont utilisées pour les tares héréditaires connues. Les premières deux lettres désignent la tare héréditaire et la dernière lettre le statut (C = carrier = porteur), (F = free = non porteur de tare), (S = porteur homozygote).
| défaut génétique | Indemne de tares héréditaires | Désignation du support |
| Arachnomélie | ARF | ARC |
| AMS | SMF | SMC |
| SDM | SDF | SDC |
| Tisserand | FORUM ÉCONOMIQUE MONDIAL | WEC |
| BH2 | B2F | B2C |
| BH6 | B6F | B6C |
| BH14 | B14F | B14C |
| BH39 | B39F | B39C |
| BH40 | B40F | B40C |
| Dysplasie rénale | RYF | RYC |
| FH2 | En personne | F2C |
| OH1 | O1F | O1C |
| OH4 | O4F | O4C |
| OH9 | O9F | O9C |
| WDR19 | WDF | WDC |
| QRICH2 | QRF | QRC |
| SPATA16 | FPS | SPC |
Les tares héréditaires mentionnées ci-dessus sont toutes transmises sur un mode récessif. Cela signifie qu'un animal ne tombe malade que s'il a reçu le gène de la tare héréditaire tant de son père que de sa mère. Brunaunvieh Schweiz recommande, Paires à risque à éviter. Un génotypage par SNP permet de se prononcer sur tous les tares génétiques actuellement connues.
homozygote Animaux porteurs d'un défaut génétique sont marqués d'un S (pour sure = certain) (par ex. B2S). Pour l'éleveur, ce cas particulier n'a aucune importance, car ces animaux ne sont généralement pas viables. L'exception ici est constituée par les animaux homozygotes porteurs du défaut génétique OH1, qui sont marqués d'un O1S. Ces animaux sont normalement viables, mais ont une déficience visuelle ou sont même aveugles. Les animaux présentant cette manifestation du défaut génétique ne devraient pas être utilisés pour l'élevage.
Les animaux sans cornes reçoivent les abréviations suivantes :
| Absence de cornes | Statut | Déclaration |
| Autodéclaration | Sans cornes | SCR (sondé et rapporté) |
| Test génétique | hétérozygote sans cornes | Porteur interrogé |
| Homozygote sans cornes | POS (interrogé en mode réel) | |
| Homozygote cornue | POF (interrogation libre) |
Si un animal a été identifié par sélection génomique comme porteur d'une cinte ou Blüem, il est noté comme suit.
| Marque | Statut | Déclaration |
| Gurt | Porteur hétérozygote | GUC |
| porteur homozygote | GUS | |
| Bleu | Porteur hétérozygote | BMC |
| porteur homozygote | BMS |
Description des tares héréditaires
Arachnomélie est également connu sous le nom d'arachnodactylie. Les veaux atteints de cette anomalie génétique naissent morts ou meurent immédiatement après la naissance. Ils présentent des os longs fins, allongés et fragiles. Les articulations sont difformes et souvent ankylosées. Le front présente une dépression et la mâchoire inférieure est fortement raccourcie. Cette anomalie génétique a été propagée principalement par le taureau Beautician chez la race Brune des Alpes.
SDM est utilisé comme abréviation pour la dysmyélinisation spinale chez la Brune des Alpes. Les veaux qui en sont atteints sont incapables de se tenir debout dès la naissance, le plus souvent en décubitus latéral avec les jambes tendues. Ils tiennent souvent la tête relevée vers l'arrière („ regardeur de lune “). Comme les veaux atteints ne répondent à aucun traitement, ils meurent généralement au cours de la première semaine de vie ou sont euthanasiés. La SDS remonte au taureau Elegant.
AMS est l'abréviation de l'atrophie musculaire spinale. Les veaux atteints de cette anomalie génétique paraissent généralement sains au début. Ce n'est qu'à l'âge d'environ 3 à 5 semaines qu'apparaissent des signes de paralysie et que les veaux restent couchés. La fonte musculaire se manifeste principalement au niveau de la gigote. Plus tard, des toux et des problèmes respiratoires s'y ajoutent souvent. Les veaux atteints d'AMS dépassent rarement l'âge de 2 mois. L'AMS trouve son origine chez le taureau Destiny et s'est propagée chez nous principalement par l'intermédiaire de Delegate, Matthew, Improver et Jetway.
Tisserand ne se manifeste que lorsque les animaux atteignent la maturité sexuelle ou sont déjà gestants. Les animaux atteints présentent une démarche mal assurée et maigrissent principalement de l'arrière-train. Le syndrome du Weaver a été transmis par les taureaux Target et Matthew.
BH2 est l'abréviation du haplotype 2 de la Brune des Alpes. Les animaux touchés naissent morts ou meurent généralement au cours des premières semaines de vie. Les animaux identifiés comme porteurs du BH2 par test génétique sont marqués du sigle B2C.
BH6 représente l'abréviation de Braunvieh Haplotyp 6. À l'état homozygote, il entraîne un avortement embryonnaire précoce. Le BH6 a été introduit en Suisse par le taureau Norvic Lilason’s Beautici-an et diffusé par Jinx King, Vigor et Prunki.
BH14 est l'abréviation de Braunvieh Haplotyp 14. À l'état homozygote, il entraîne un avortement embryonnaire précoce. Ce trouble est associé au gène L55, qui provoque également des troubles de la fertilité chez d'autres espèces animales. Le BH14 a été diffusé dans la population suisse par les taureaux R Hart Christians Ace et R Hart TC Denmark.
BH39 est l'abréviation de Braunvieh Haplotyp 39. Une mutation dans cet haplotype est associée à des pertes d'élevage chez les bovins. Les animaux homozygotes présentent des colorations dentaires, un développement corporel réduit et sont sensibles aux maladies. Des pneumonies et des diarrhées récurrentes surviennent fréquemment. Nesta a été le premier taureau à propager le BH39 dans la population suisse.
BH40 est l'abréviation de Braunvieh Haplotyp 40 (haplotype de la Brune des Alpes 40). Une mutation de cet haplotype est associée à la subfertilité femelle chez les bovins ; les animaux homozygotes sont presque stériles, quel que soit le taureau utilisé pour l'insémination ou la saillie. Des études fonctionnelles suggèrent un problème entre la fécondation et la division cellulaire. En outre, certains animaux homozygotes présentent des anomalies de la démarche d'intensité variable, notamment le croisement des membres postérieurs, une démarche raide ou d'autres problèmes neuromusculaires. Jinx King est le porteur connu le plus ancien.
Dysplasie rénale est une maladie génétique connue depuis longtemps chez la race Brune des Alpes (Grauvieh). Certains animaux de la race Brown Swiss présentent également ce défaut et affichent les mêmes symptômes (animaux chétifs, pelage hirsute, croissance excessive des onglons), qui sont dus à un trouble de la fonction rénale. La fréquence de cette tare génétique étant extrêmement faible chez les Brown Swiss, seuls les animaux porteurs sont déclarés.
FH2 est l'abréviation de l'haplotype 2 du Fleckvieh. Il s'agit d'un ancien défaut génétique que l'on trouve aussi bien dans la population de Fleckvieh que dans celle de la tachetée de l'Est (OB). Les animaux atteints présentent une croissance fortement réduite au cours des premières semaines de leur vie. À moyen terme, ils ne sont pas viables. Les animaux OB et ROB identifiés comme porteurs de FH2 sont marqués du sigle F2C.
OH1 est l'abréviation de Original Braunvieh Haplotype 1. L'OH1 est une tare génétique que l'on trouve chez le bétail OB. Les animaux concernés présentent une déficience visuelle plus ou moins prononcée. Cette déficience visuelle n'est parfois remarquée que lorsque l'animal est déjà un peu plus âgé. Chez le Brown Swiss, l'OH1 n'apparaît qu'à une fréquence très faible et n'est donc publié que chez les animaux OB et ROB. L'exception concerne ici les animaux homozygotes porteurs de la tare génétique OH1, qui sont identifiés par la mention O1S. Ces animaux sont normalement viables, mais présentent une déficience visuelle ou sont même aveugles. Ces animaux ne doivent pas être utilisés pour l'élevage.
OH4 est l'abréviation de Original Braunvieh Haplotype 4. À l'état homozygote, il entraîne un avortement embryonnaire précoce. Le plus ancien porteur connu est le taureau Oswald.
OH9 correspond à l'abréviation de Original Braunvieh Haplotyp 9. À l'état homozygote, cet haplotype entraîne, tout comme OH4, un avortement embryonnaire précoce. Le plus ancien porteur connu est le taureau Voeris.
WDR19 désigne un gène dont la mutation altère la fertilité masculine. Les taureaux homozygotes présentent des performances de reproduction réduites. La race concernée est la Brune, comprenant les deux sélections Brown Swiss et Original Braunvieh. Le défaut génétique n'affectant que la fertilité masculine, seuls les mâles porteurs sont déclarés.
QRICH2 désigne un gène dont la mutation altère la fertilité masculine. Il entraîne une concentration de spermatozoïdes fortement réduite ainsi que des spermatozoïdes immobiles présentant de nombreuses anomalies morphologiques. Les taureaux homozygotes sont presque infertiles. La race Braunvieh est concernée, dans ses deux orientations d'élevage Brown Swiss et Original Braunvieh. Comme le défaut génétique n'affecte que la fertilité masculine, seuls les animaux porteurs mâles sont déclarés.
SPATA16 désigne la mutation d'un gène qui entraîne une fertilité masculine réduite. La formation des spermatozoïdes est altérée, ce qui se traduit par une baisse des performances de reproduction. La race concernée est la Brune, avec ses deux orientations d'élevage, Brown Swiss et Brune originelle. Le défaut génétique n'affectant que la fertilité masculine, seuls les mâles porteurs sont déclarés.